Реактивность нейтрофилоподобных клеток HL-60 при взаимодействии с персистирующими формами Escherichia coli
Цель исследования — сравнить реактивность нейтрофилоподобных клеток HL-60 при взаимодействии с персистерами и нативными клетками Escherichia coli, используя в качестве критерия интенсивность респираторного взрыва.
Материалы и методы. Персистирующие формы (персистеры) E. сoli получали путем последовательной инкубации бактерий в растворах карбонил цианид 3-хлорфенилгидразона (CCCP) и ципрофлоксацина. В качестве нейтрофилоподобных клеток использовали дифференцированные клетки линии HL-60 (ATCC CCL-240). Оценку респираторного взрыва нейтрофилоподобных клеток в реакции с нативными клетками и персистерами E. сoli проводили на микропланшетном ридере Infinite M200 путем измерения интенсивности флюоресценции окисленных форм красителя Amplex Red.
Результаты. Количество жизнеспособных E. сoli до и после инкубации с СССР и ципрофлоксацином было примерно одинаковым. Это свидетельствует о том, что данную технологию можно с успехом использовать для получения клеток E. сoli в форме персистеров. Нативные клетки E. сoli вызывали статистически значимое увеличение показателей респираторного взрыва нейтрофилоподобных клеток, составляя 14±4% от значений положительного контроля (в негативном контроле значения составляли 6±3%). Показатели респираторного взрыва нейтрофилоподобных клеток в системе с персистерами E. сoli были существенно выше, чем это наблюдалось с нативными E. сoli, и составляли 42±7% от положительного контроля.
Заключение. Персистеры E. сoli могут стимулировать респираторный метаболизм фагоцитирующих нейтрофилоподобных клеток линии HL-60. Способность этих персистеров вызывать респираторный взрыв нейтрофилов выражена существенно сильнее, чем у нативных бактерий E. сoli.
Введение
Одной из самых актуальных проблем современной медицинской науки является прогрессирующая устойчивость бактерий к антимикробным препаратам. Известно несколько механизмов, позволяющих бактериям выживать в присутствии антибиотиков. До недавнего времени считалось, что существует пять типов механизмов резистентности: модификация мишени, инактивация антибиотика, активное выведение антибиотика из микробной клетки (эффлюкс), нарушение проницаемости внешних структур микробной клетки, формирование метаболического «шунта» [1]. Сейчас этот перечень дополняют еще двумя механизмами резистентности, к которым относятся биопленочная резистентность [2] и формирование особых форм бактериальных клеток — персистеров, или персистирующих бактерий [3]. Персистеры (персистирующие бактерии) — это метаболически неактивные формы бактерий, которые толерантны к антибиотикам [4].
В настоящее время над исследованием персистирующих бактериальных клеток работает значительное количество научных коллективов: в 2018 г., по данным PubMed, было опубликовано более 150 научных работ, касающихся изучения персистирующих бактерий. Физиология их исследована достаточно детально. Изучены процессы формирования персистеров [3, 5], расшифрованы механизмы их обратной трансформации в нормально функционирующую бактерию [6]. Разработаны способы накопления персистеров — удалось добиться того, что в бактериальной популяции присутствует 80–90% персистеров [7–9]. Исследованы особенности «замороженного» метаболизма этих форм, расшифрованы молекулярные основы устойчивости таких бактерий к антибиотикам [10, 11]. Изучены особенности поверхностных структур персистеров [12]. Предложены методы морфологического и функционального исследования бактерий-персистеров [13]. Однако остаются неясными вопросы, касающиеся вирулентности персистеров и особенностей их взаимоотношений с клеточными и тканевыми структурами организма человека. В частности, исследование взаимоотношений персистеров с иммунной системой является крайне актуальной задачей современной биомедицинской науки. Очень важно понимание механизмов реакций между наиболее значимыми иммунными эффекторами человека — нейтрофилами и персистирующими бактериями. К настоящему моменту исследована только одна сторона этого явления — фагоцит-индуцированное формирование персистеров [14]. Другая сторона, а именно вопрос, как фагоциты реагируют на бактерии-персистеры, остается неизученной.
Цель настоящей работы — сравнить реактивность нейтрофилоподобных клеток HL-60 при взаимодействии с персистерами и нативными клетками актуального оппортунистического патогена Escherichia coli, используя в качестве критерия интенсивность респираторного взрыва.
Материалы и методы
Получение бактерий-персистеров. Клетки-персистеры получали по общепринятой методике культивирования бактерий. В нашем исследовании использовали референсные штаммы E. coli ATCC 25922 в среде с добавлением 200 мкг/мл карбонил цианид 3-хлорфенилгидразона (carbonyl cyanide m-chlorophenyl hydrazine, CCCP) [15]. Суточную культуру бактерий вносили в бульон Луриа–Бертани (бульон LB; Becton Dickinson, США) до получения мутности 0,5 ед. по шкале МакФарланда, затем 0,5 мл полученной суспензии переносили в 5 мл бульона LB и инкубировали 18 ч при 37°C. Из 18-часовой культуры отбирали три пробы объемом 0,98 мл.
Обработка проб включала два этапа. На первом этапе в 1-ю пробу вносили 0,02 мл CCCP (Sigma-Aldrich, США), растворенного в диметилсульфоксиде — dimethyl sulfoxide, DMSO (Molegular Probes, США) в концентрации 10 мг/мл, во 2-ю и 3-ю пробы — по 0,02 мл DMSO. Пробы инкубировали в шейкере при 37°C в течение 3 ч, затем дважды отмывали в физрастворе и ресуспендировали в 0,2 мл бульона LB.
На втором этапе к 1-й и 2-й пробам добавляли 0,2 мл бульона LB с ципрофлоксацином («Синтез», Россия) в концентрации 10 мкг/мл, к 3-й пробе — 0,2 мл бульона LB без антибиотика. Инкубацию выполняли при условиях, описанных в 1-м этапе. Пробы дважды отмывали и ресуспендировали в 1 мл буфера HEPES (Sigma-Aldrich). Для подтверждения наличия в 1-й пробе бактерий-персистеров без примеси нативных бактерий делали контрольные высевы из пробы до и после инкубации с ципрофлоксацином. По 0,02 мл 100-кратных разведений пробы рассевали на чашки с агаром Мюллера–Хинтона (Bio-Rad Laboratories, США). Чашки инкубировали в течение 24 ч при 37°C, затем проводили подсчет колониеобразующих единиц (КОЕ). Критерием наличия персистеров служил рост примерно одинакового числа КОЕ в пробах до и после инкубации с ципрофлоксацином [15]. После инкубации выполняли стандартизацию концентрации бактериальных клеток на проточном цитофлюориметре NovoCyte (ACEA Biosciences, США). Анализ полученных данных о популяции бактериальных клеток осуществляли при помощи программного обеспечения NovoExpress software. Для каждого образца анализировали минимум 1·106/мл бактериальных клеток. Количественное определение исследуемых бактерий проводили без применения флюоресцентных красителей, измеряя прямое светорассеивание и боковое светорассеяние каждой бактериальной клетки.
Получение фагоцитирующих клеток: культивирование и дифференцировка клеточной линии HL-60. В качестве источника фагоцитирующих нейтрофилоподобных клеток использовали промиелоцитарную линию клеток HL-60 (ATCC CCL-240), находящихся на стадии развития миелобласта. Для создания среды культивирования к минимальной питательной среде (IMDM) добавляли фетальную бычью сыворотку (HI FBS; Gibco, США) до конечной концентрации 20%, L-глутамин (Glutamax; Gibco) до конечной концентрации 1% и пенициллин-стрептомицин (Pen Strep; Gibco) до конечной концентрации 1%. Клеточную линию выращивали до уровня
(5–8)·105 кл./мл в полной среде и пересевали каждые 3–4 дня путем центрифугирования при 1500 об./мин в течение 5 мин. Для запуска дифференцировки доводили концентрацию культуры клеток до плотности 3·105 кл./мл и инкубировали в течение ночи, чтобы получить популяцию экспоненциально растущей культуры клеток. Затем доводили экспоненциально растущие клетки до плотности 3·105 кл./мл в полной питательной среде, дополненной до конечной концентрации 1,25% DMSO с целью индукции дифференцировки и созревания нейтрофилоподобных клеток в течение 5 дней. После 5 дней дифференцировки HL-60 отмывали центрифугированием при 1500 об./мин в течение 5 мин, отбирали супернатант и отмывали клеточную взвесь центрифугированием при тех же условиях в HEPES-буфере, обогащенном Ca2+ и человеческим сывороточным альбумином. После такой промывки клетки разводили в этом же буфере, оценивали их жизнеспособность и осуществляли подсчет при помощи клеточного счетчика с использованием трипанового синего. После подсчета культуры клеток для достижения реакции респираторного взрыва HL-60 доводили до концентрации 1·106/мл в полном HEPES-буфере.
Оценка респираторного взрыва. Для оценки респираторного взрыва нейтрофилоподобных клеток HL-60 в реакции с нативными клетками E. сoli и E. coli-персистерами (соотношение бактерии/фагоциты — 40/1) использовали известный метод, основанный на флюоресценции окисленных форм красителя Amplex Red (Molecular Probes, США). В качестве положительного контроля реакции использовали форбол-12-миристат-13-ацетат, а в качестве отрицательного — HEPES-буфер. Результаты выражали в процентах относительно показателей стимуляции (средний угол наклона кривой за 30 мин реакции) нейтрофилоподобных клеток HL-60 форбол-12-миристат-13-ацетатом. Количественную оценку респираторного взрыва проводили на микропланшетном ридере Infinite M200 (Tecan Group Ltd., Швейцария). Кинетическое определение флюоресценции респираторного взрыва между изучаемыми микроорганизмами и эффекторными клетками осуществляли в течение 40 мин с детекцией флюоресценции каждую минуту в течение 40 циклов, при возбуждении 545 нм и излучении 590 нм. Все эксперименты были выполнены в 4–6 повторениях, все пробы были включены в эксперимент в триплетах.
Полученная информация была статистически обработана при помощи штатного программного обеспечения, управляющего работой ридера Infinite M200.
Результаты и обсуждение
Количество жизнеспособных бактерий в пробах до и после инкубации с ципрофлоксацином было примерно одинаковым и составляло 3,3·105 и 3,2·105 КОЕ/мл соответственно (p>0,05). Согласно критериям L. Grassi и соавт. [15], такие результаты свидетельствуют о том, что 1-я проба после обработки ципрофлоксацином содержала преимущественно клетки E. сoli в форме персистеров.
Динамика типовой реакции респираторного взрыва нейтрофилоподобных клеток HL-60 при взаимодействии с разными формами (персистерами и нативными бактериями) E. сoli показана на рисунке. Количественные показатели активации респираторного взрыва нейтрофилоподобных клеток HL-60 при взаимодействии с разными формами (персистерами и нативными бактериями) E. сoli представлены в таблице. Нативные клетки E. сoli вызывали статистически значимое ускорение окисления флюорофора Amplex Red в системе с нейтрофилоподобными клетками: угол наклона кривой составлял более 14% от значений положительного контроля (в негативном контроле — 6±3%). Скорость окисления Amplex Red в системе «E. сoli-персистеры–нейтрофилоподобные клетки» была существенно выше, чем это наблюдалось с нативными E. сoli, и составляла 42±7% от положительного контроля.
|
Показатели активации респираторного взрыва нейтрофилоподобных клеток HL-60 при взаимодействии с нативными бактериями и персистерами (средний угол наклона кривой за 30 мин реакции) |
Результаты показали, что и нативные бактерии E. сoli, и E. сoli-персистеры обладают способностью активировать респираторный метаболизм фагоцитов. Однако нейтрофилоподобные клетки отвечали на контакт с бактериями-персистерами E. сoli более интенсивно, чем в случае взаимодействия с нативными бактериями. Это может быть связано со сниженным метаболическим профилем персистеров [8]. Угнетение метаболизма неизбежно ведет к замедлению всех энергозависимых реакций бактериальной клетки, включая механизмы ускользания от иммунных эффекторов. Нативные бактерии с нормальным воспроизводством энергии сохраняют и проявляют антифагоцитарные свойства, снижая фагоцитоз и респираторный взрыв нейтрофилов. Это доказано для всех бактерий, обладающих патогенным потенциалом [16]. Клетки E. сoli не являются исключением, реализация вирулентности у них служит энергозависимым процессом, блокада которого приводит к угнетению антифагоцитарной защиты [17]. Обнаруженная закономерность внушает оптимизм: бактерии-персистеры не являются неуязвимыми и могут быть элиминированы за счет фагоцитарных реакций.
Заключение
Полученные результаты позволяют сделать несколько важных выводов. Во-первых, бактерии-персистеры E. сoli могут стимулировать респираторный метаболизм фагоцитирующих нейтрофилоподобных клеток линии HL-60. Во-вторых, способность персистеров E. сoli стимулировать респираторный взрыв нейтрофилов выражена существенно сильнее, чем у нативных бактерий E. сoli. Это свидетельствует о том, что важнейшие эффекторы иммунитета, нейтрофилы, способны распознавать персистеры E. сoli и атаковать их.
Финансирование исследования. Работа выполнена при финансовой поддержке Российского фонда фундаментальных исследований (проект №18-015-00301 «Реактивность нейтрофилов при взаимодействии с грамотрицательными бактериями-персистерами»).
Конфликт интересов. Авторы заявляют об отсутствии конфликтов интересов.
Литература
- Практическое руководство по антиинфекционной химиотерапии. Под ред. Страчунского Л.С., Белоусова Ю.Б., Козлова С.Н. Смоленск: НИИАХ СГМА; 2002; 586 с.
- Чеботарь И.В., Маянский А.Н., Кончакова Е.Д., Лазарева А.В., Чистякова В.П. Антибиотикорезистентность биопленочных бактерий. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия 2012; 14(1): 51–58.
- Lewis K. Persister cells. Annu Rev Microbiol 2010; 64(1): 357–372, https://doi.org/10.1146/annurev.micro.112408.134306.
- Евдокимова Н.В., Черненькая Т.В. Персистирующие клетки микроорганизмов — новый взгляд на старую проблему. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия 2013; 15(3): 192–197.
- Wood T.K., Knabel S.J., Kwan B.W. Bacterial persister cell formation and dormancy. Appl Environ Microbiol 2013; 79(23): 7116–7121, https://doi.org/10.1128/aem.02636-13.
- Jõers A., Kaldalu N., Tenson T. The frequency of persisters in Escherichia coli reflects the kinetics of awakening from dormancy. J Bacteriol 2010; 192(13): 3379–3384, https://doi.org/10.1128/jb.00056-10.
- Kaldalu N., Jõers A., Ingelman H., Tenson T. A general method for measuring persister levels in Escherichia coli cultures. Methods Mol Biol 2016; 1333: 29–42, https://doi.org/10.1007/978-1-4939-2854-5_3.
- Fisher R.A., Gollan B., Helaine S. Persistent bacterial infections and persister cells. Nat Rev Microbiol 2017; 15(8): 453–464, https://doi.org/10.1038/nrmicro.2017.42.
- Helaine S., Kugelberg E. Bacterial persisters: formation, eradication, and experimental systems. Trends Microbiol 2014; 22(7): 417–424, https://doi.org/10.1016/j.tim.2014.03.008.
- Prax M., Bertram R. Metabolic aspects of bacterial persisters. Front Cell Infect Microbiol 2014; 4: 148, https://doi.org/10.3389/fcimb.2014.00148.
- Amato S.M., Fazen C.H., Henry T.C., Mok W.W., Orman M.A., Sandvik E.L., Volzing K.G., Brynildsen M.P. The role of metabolism in bacterial persistence. Front Microbiol 2014; 5: 70, https://doi.org/10.3389/fmicb.2014.00070.
- Molina-Quiroz R.C., Lazinski D.W., Camilli A., Levy S.B. Transposon-sequencing analysis unveils novel genes involved in the generation of persister cells in uropathogenic Escherichia coli. Antimicrob Agents Chemother 2016; 60(11): 6907–6910, https://doi.org/10.1128/aac.01617-16.
- Orman M.A., Brynildsen M.P. Establishment of a method to rapidly assay bacterial persister metabolism. Antimicrob Agents Chemother 2013; 57(9): 4398–4409, https://doi.org/10.1128/aac.00372-13.
- Fisher R.A., Cheverton A.M., Helaine S. Analysis of macrophage-induced salmonella persisters. Methods Mol Biol 2016; 1333: 177–178, https://doi.org/10.1007/978-1-4939-2854-5_15.
- Grassi L., Di Luca M., Maisetta G., Rinaldi A.C., Esin S., Trampuz A., Batoni G. Generation of persister cells of Pseudomonas aeruginosa and Staphylococcus aureus by chemical treatment and evaluation of their susceptibility to membrane-targeting agents. Front Microbiol 2017; 8: 1917, https://doi.org/10.3389/fmicb.2017.01917.
- Маянский А.Н., Маянский Д.Н. Очерки о нейтрофиле и макрофаге. Новосибирск: Наука; 1989; 344 с.
- Santos A.S., Finlay B.B. Bringing down the host: enteropathogenic and enterohaemorrhagic Escherichia coli effector-mediated subversion of host innate immune pathways. Cell Microbiol 2015; 17(3): 318–332, https://doi.org/10.1111/cmi.12412.