Верификация однонуклеотидных полиморфизмов rs34554140, rs6670279, rs6874185 в качестве новых молекулярно-генетических маркеров внезапной сердечной смерти

Цель исследования — проверить ассоциацию с внезапной сердечной смертью (ВСС) однонуклеотидных полиморфизмов rs34554140, rs6670279, rs6874185 из списка новых возможных молекулярно-генетических маркеров ВСС, полученного в ходе собственного полногеномного аллелотипирования на образцах пулированной ДНК.

Материалы и методы. Исследование построено по принципу «случай–контроль». Группа ВСС включала 438 умерших жителей Новосибирска (средний возраст — 53,2±9,1 года, мужчины — 72,7%, женщины — 28,3%) с основными патологоанатомическими диагнозами «острая недостаточность кровообращения», «острая коронарная недостаточность», что соответствует критериям ВСС Европейского общества кардиологов. В контрольную группу были включены 435 участников международных проектов HAPIEE, MONICA, живых на момент проведения исследования (средний возраст — 53,2±8,9 года, мужчины — 70,0%, женщины — 30,0%). ДНК выделяли методом фенол-хлороформной экстракции из ткани миокарда в группе ВСС и из венозной крови в группе контроля. Генотипирование выполнено методом полимеразной цепной реакции с последующим анализом полиморфизма длин рестрикционных фрагментов в полиакриламидном геле.

Результаты. Частоты генотипов однонуклеотидных полиморфизмов rs34554140, rs6670279, rs6874185 в группе контроля соответствуют ожидаемым согласно равновесию Харди–Вайнберга (=0,98; 0,009; 3,39 соответственно). Генотип АА rs34554140 ассоциирован с повышенным риском ВСС (р=0,002; ОШ=1,85; 95% CI 1,26–2,71). Генотип АТ обладает протективным эффектом в отношении ВСС (р=0,001; ОШ=0,53; 95% CI 0,36–0,78). При разделении групп по полу и возрасту выявленные различия сохраняются в подгруппах мужчин, женщин, лиц младше 50 лет (p<0,05). Генотип АА rs6670279 ассоциирован с повышенным риском ВСС (р=0,005; ОШ=1,54; 95% CI 1,15–2,06). Генотип АТ обладает протективным эффектом в отношении ВСС (р=0,047; ОШ=0,73; 95% CI 0,54–0,98). При разделении групп по полу и возрасту выявленные различия сохраняются в подгруппах мужчин, лиц старше 50 лет и мужчин старше 50 лет (p<0,05). Не найдено статистически значимых различий по частотам генотипов и аллелей однонуклеотидного полиморфизма rs6874185 между группой ВСС и контрольной, в том числе при разделении групп по полу и возрасту (р>0,05).

Заключение. Подтверждена ассоциация однонуклеотидных полиморфизмов rs34554140 и rs6670279 с ВСС. Данных о наличии ассоциации rs6874185 с ВСС не обнаружено.

1. Jazayeri M.A., Emert M.P. Sudden cardiac death: who is at risk? Med Clin North Am 2019; 103(5): 913–930, https://doi.org/10.1016/j.mcna.2019.04.006.
2. Isbister J., Semsarian C. Sudden cardiac death: an update. Intern Med J 2019; 49(7): 826–833, https://doi.org/10.1111/imj.14359.
3. Priori S.G., Blomström-Lundqvist C., Mazzanti A., Blom N., Borggrefe M., Camm J., Elliott P.M., Fitzsimons D., Hatala R., Hindricks G., Kirchhof P., Kjeldsen K., Kuck K.H., Hernandez-Madrid A., Nikolaou N., Norekvål T.M., Spaulding C., Van Veldhuisen D.J. The task force for the management of patients with ventricular arrhythmias and the prevention of sudden cardiac death of the European Society of Cardiology (ESC). G Ital Cardiol (Rome) 2016; 17(2): 108–170, https://doi.org/10.1714/2174.23496.
4. Бабенко В.Н., Максимов В.Н., Кулакова Е.В., Сафро­нова Н.С., Воевода М.И., Рогаев Е.И. Полногеномный анализ пулированных выборок ДНК когорт человека. Вавиловский журнал генетики и селекции 2014; 18(4–2): 847–855.
5. Reference SNP (refSNP) cluster report: rs34554140. URL: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/SNP/ snp_ref.cgi?do_not_redirect&rs=rs34554140.
6. Reference SNP (refSNP) cluster report: rs6670279. URL: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/SNP/ snp_ref.cgi?do_not_redirect&rs=rs6670279.
7. Yamagishi K., Iso H. The criteria for metabolic syndrome and the national health screening and education system in Japan. Epidemiol Health 2017; 39: e2017003, https://doi.org/10.4178/epih.e2017003.
8. Nagata Y., Konno T., Fujino N., Hodatsu A., Nomura A., Hayashi K., Nakamura H., Kawashiri M.A., Yamagishi M. Right ventricular hypertrophy is associated with cardiovascular events in hypertrophic cardiomyopathy: evidence from study with magnetic resonance imaging. Can J Cardiol 2015; 31(6): 702–708, https://doi.org/10.1016/j.cjca.2014.12.036.
9. Reference SNP (refSNP) cluster report: rs6874185. URL: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/SNP/ snp_ref.cgi?do_not_redirect&rs=rs6874185.

Ivanova A.A., Gurazheva A.A., Melnikova E.S., Nesterets A.M., Malyutina S.K., Rodina I.A., Maksimov V.N. Verification of Single Nucleotide Polymorphisms rs34554140, rs6670279, and rs6874185 as Novel Molecular Genetic Markers of Sudden Cardiac Death. Sovremennye tehnologii v medicine 2021; 13(2): 40, https://doi.org/10.17691/stm2021.13.2.04