Использование MALDI-TOF-технологии для идентификации возбудителей септических состояний в педиатрической практике
Цель исследования — оценка эффективности использования MALDI-TOF-масс-спектрометрии для идентификации микроорганизмов из малых объемов крови (1–4 мл), полученных от детей с подозрением на септические состояния, путем сравнения ее результатов с данными классического микробиологического исследования.
Материалы и методы. Объектами исследования являлись образцы крови детей с подозрением на развитие септического состояния. Для анализа использовали гемокультуры, в которых регистрировался микробный рост на инкубаторе BACTEC 9050. Идентификацию возбудителя из гемокультуры осуществляли двумя способами — классическим микробиологическим и на основе MALDI-TOF-масс-спектрометрии с применением в качестве матрицы α-циано-4-гидроксикоричной кислоты. Для сравнения эффективности двух методов идентификации возбудителей инфекций кровотока применяли стандартный статистический прием, направленный на определение степени парной согласованности результатов, — каппы Коэна.
Результаты. Данные, полученные при помощи масс-спектрометрического MALDI-TOF-метода идентификации микроорганизмов в гемокультурах от детей с инфекциями кровотока, содержащих один микроб-возбудитель, имеют высокую степень соответствия данным классического микробиологического исследования (каппа Коэна составляет 0,96; р<0,001). Совпадение результатов MALDI-TOF-масс-спектрометрии и классического микробиологического анализа при исследовании полимикробных культур характеризовалось слабой согласованностью (каппа Коэна составляет 0,58; р>0,05).
Заключение. MALDI-TOF-масс-спектрометрическая идентификация возбудителей инфекций кровотока может быть рекомендована в качестве дополнительного метода диагностики, направленного на сокращение времени анализа.
- Silva E., Passos R.H.D., Ferri M.B., de Figueiredo L.F.P. Sepsis: from bench to bedside. Clinics 2008; 63(1): 109–120, http://dx.doi.org/10.1590/s1807-59322008000100019.
- Mayr F.B., Yende S., Angus D.C. Epidemiology of severe sepsis. Virulence 2014; 5(1): 4–11, http://dx.doi.org/10.4161/viru.27372.
- Angus D.C., Linde-Zwirble W.T., Lidicker J., Clermont G., Carcillo J., Pinsky M.R. Epidemiology of severe sepsis in the United States: analysis of incidence, outcome, and associated costs of care. Crit Care Med 2001; 29(7): 1303–1310, http://dx.doi.org/10.1097/00003246-200107000-00002.
- Багирова Н.С. Современное состояние диагностики бактериемии. Сопроводительная терапия в онкологии 2006; 3: 23–38.
- Чеботкевич В.Н., Кайтанджан Е.И., Бурылев В.В., Щетинкина Е.Е. Современные методы лабораторной диагностики сепсиса. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерия 2013; 15(4): 295–300.
- Jordana-Lluch E., Giménez M., Quesada MD, Ausina V., Martró E. Improving the diagnosis of bloodstream infections: PCR coupled with mass spectrometry. Biomed Res Int 2014; 2014: ID 501214, http://dx.doi.org/10.1155/2014/501214.
- Маянский Н.А., Калакуцкая А.Н., Мотузова О.В., Ломинадзе Г.Г., Крыжановская О.А., Катосова Л.К. MALDI-TOF масс-спектрометрия в рутинной работе микробиологической лаборатории. Вопросы диагностики в педиатрии 2011; 3(5): 20–25.
- Tadros M., Petrich A. Evaluation of MALDI-TOF mass spectrometry and Sepsityper Kit™ for the direct identification of organisms from sterile body fluids in a Canadian Pediatric Hospital. Can J Infect Dis Med Microbiol 2013; 24(4): 191–194.
- Tsai M.H., Chu S.M., Hsu J.F., Lien R., Huang H.R., Chiang M.C., Fu R.H., Lee C.W., Huang Y.C. Polymicrobial bloodstream infection in neonates: microbiology, clinical characteristics, and risk factors. PLoS One 2014; 9(1): e83082, http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0083082.
- Gray T.J., Thomas L., Olma T., Iredell J.R., Chen S.C. Rapid identification of Gram-negative organisms from blood culture bottles using a modified extraction method and MALDI-TOF mass spectrometry. Diagn Microbiol Infect Dis 2013; 77(2): 110–112, http://dx.doi.org/10.1016/j.diagmicrobio.2013.06.016.
- Крыжановская О.А., Лазарева А.В., Пономаренко О.А., Катосова Л.К., Тепаев Р.Ф., Карасева О.В., Чеботарь И.В. Масс-спектрометрическая идентификация возбудителей инфекций кровотока: опыт в педиатрической практике. Российский педиатрический журнал 2014; 17(5): 4–9.
- Fleiss J.L., Levin B., Paik M.C. Statistical methods for rates and proportions. New York: John Wiley & Sons, Inc.; 2003, http://dx.doi.org/10.1002/0471445428.
- Припутневич Т.В., Мелкумян А.Р., Бурменская О.В., Непша О.С., Никитина И.В., Любасовская Л.А., Ионов О.В., Ильина Е.Н., Трофимов Д.Ю., Митрохин С.Д. Использование методов MALDI-TOF масс-спектрометрии и количественной ПЦР для быстрой диагностики септических состояний. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия 2014; 16(1): 4–9.
- La Scola B. Intact cell MALDI-TOF mass spectrometry-based approaches for the diagnosis of bloodstream infections. Expert Rev Mol Diagn 2011; 11(3): 287–298.